研究报告/Research Report

虎眼万年青鳞茎转录组特性分析  

姜福星1 , 江欣燕1 , 吴生2 , 杨丽娟1 , 李文骥1 , 陈其兵1
1.四川农业大学园林研究所,成都,611300
2.广东虎眼万年青种植场,中山,528429
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 17 篇   
收稿日期: 2015年07月22日    接受日期: 2015年08月10日    发表日期: 2015年09月13日
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推荐引用:

Jiang F.X., Jiang X.Y., Wu S., Yang L.J., Li W.Y., Chen Q.B., 2015, Transcriptome sequencing and characteristic analysis of Ornithogalum caudatum, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(9): 2038-2050 (姜福星, 江欣燕, 吴生, 杨丽娟, 李文骥, 陈其兵, 2015, 虎眼万年青鳞茎转录组特性分析, 分子植物育种, 13(9): 2038-2050)

摘 要

虎眼万年青具有很高的药用价值和经济价值,鳞茎是其主要的药用和繁殖器官,然而虎眼万年青鳞茎的分子生物学信息严重缺乏成为制约其研究生产的瓶颈。为获得虎眼万年青鳞茎的转录组信息,应用高通量测序技术对虎眼万年青鳞茎进行测序分析。采用His4000测序平台共获得8.2 G原始数据,经过整理分析后,获得7.6 G有效数据和121 223条Unigene;经过与NR、GO、COG及KEGG等数据库进行比较分析后,56 374条Unigene获得NR数据库的注释,39 263条Unigene获得GO数据库的注释,12 388条Unigene获得COG功能注释,5 405条Unigene参与了新陈代谢途径,2 477条Unigene参与了次生代谢途径,166条 Unigene参与了萜类的合成,195条Unigene参与了生物碱的合成,295条Unigene作为转录因子参与新陈代谢过程调控。研究结果为采用生物技术手段提高虎眼万年青的药用成分的含量及改善其园艺性状提供了分子数据。

关键词
虎眼万年青;鳞茎;转录组测序;特性分析
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《分子植物育种》印刷版
• 第 13 卷
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